Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Chl1P70232 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chl1P70232 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chl1P70232 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chl1P70232 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chl1P70232 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chl1P70232 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms