Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf6P70196 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms