Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabrb3P63080 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms