Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp46P62069 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp46P62069 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp46P62069 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp46P62069 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp46P62069 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp46P62069 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp46P62069 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp46P62069 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp46P62069 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp46P62069 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp46P62069 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp46P62069 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp46P62069 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms