Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr2iP60898 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr2iP60898 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr2iP60898 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr2iP60898 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr2iP60898 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr2iP60898 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr2iP60898 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr2iP60898 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr2iP60898 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr2iP60898 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr2iP60898 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr2iP60898 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr2iP60898 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr2iP60898 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr2iP60898 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr2iP60898 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Polr2iP60898 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms