Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rin3P59729 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms