Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr3bP59470 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3bP59470 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3bP59470 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3bP59470 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3bP59470 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3bP59470 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3bP59470 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3bP59470 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3bP59470 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3bP59470 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3bP59470 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3bP59470 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3bP59470 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr3bP59470 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms