Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup43P59235 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup43P59235 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms