Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpdl3bP58242 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms