Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmoP56726 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmoP56726 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmoP56726 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmoP56726 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmoP56726 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmoP56726 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmoP56726 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmoP56726 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmoP56726 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmoP56726 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms