Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TdgP56581 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TdgP56581 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TdgP56581 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TdgP56581 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TdgP56581 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TdgP56581 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TdgP56581 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TdgP56581 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TdgP56581 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TdgP56581 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TdgP56581 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TdgP56581 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TdgP56581 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TdgP56581 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TdgP56581 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TdgP56581 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TdgP56581 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TdgP56581 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TdgP56581 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TdgP56581 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TdgP56581 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TdgP56581 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TdgP56581 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TdgP56581 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TdgP56581 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TdgP56581 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TdgP56581 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TdgP56581 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TdgP56581 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TdgP56581 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TdgP56581 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TdgP56581 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TdgP56581 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TdgP56581 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms