Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5bP56480 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms