Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irf5P56477 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irf5P56477 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irf5P56477 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irf5P56477 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irf5P56477 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irf5P56477 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irf5P56477 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irf5P56477 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irf5P56477 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irf5P56477 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irf5P56477 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irf5P56477 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irf5P56477 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irf5P56477 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irf5P56477 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Irf5P56477 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Irf5P56477 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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Irf5P56477 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irf5P56477 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Irf5P56477 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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Irf5P56477 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Irf5P56477 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Irf5P56477 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Irf5P56477 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Irf5P56477 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Irf5P56477 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Irf5P56477 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irf5P56477 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Irf5P56477 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irf5P56477 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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