Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gp1bbP56400 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms