Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GemP55041 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GemP55041 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GemP55041 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GemP55041 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GemP55041 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GemP55041 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GemP55041 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GemP55041 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GemP55041 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GemP55041 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GemP55041 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GemP55041 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GemP55041 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GemP55041 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GemP55041 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GemP55041 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GemP55041 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GemP55041 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GemP55041 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GemP55041 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GemP55041 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GemP55041 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GemP55041 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GemP55041 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GemP55041 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GemP55041 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GemP55041 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GemP55041 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GemP55041 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GemP55041 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
GemP55041 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GemP55041 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms