Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb4P54761 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb4P54761 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms