Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CcnfP51944 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnfP51944 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CcnfP51944 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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