Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec1P51908 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms