Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccr5P51682 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccr5P51682 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms