Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CntfP51642 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfP51642 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfP51642 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfP51642 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CntfP51642 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CntfP51642 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CntfP51642 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CntfP51642 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CntfP51642 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CntfP51642 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CntfP51642 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CntfP51642 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfP51642 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms