Protein–RNA interactions for Protein: P50428

Arsa, Arylsulfatase A, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArsaP50428 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ArsaP50428 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ArsaP50428 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms