Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb42P49222 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb42P49222 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms