Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LmnaP48678 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LmnaP48678 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LmnaP48678 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms