Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic1P46684 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic1P46684 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms