Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf1P46099 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms