Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc19a1P41438 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc19a1P41438 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc19a1P41438 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc19a1P41438 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc19a1P41438 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc19a1P41438 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms