Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LtbP41155 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbP41155 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbP41155 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LtbP41155 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LtbP41155 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LtbP41155 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
LtbP41155 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
LtbP41155 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LtbP41155 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbP41155 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LtbP41155 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LtbP41155 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms