Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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