Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vps26aP40336 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms