Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms