Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lig1P37913 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms