Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PpargP37238 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PpargP37238 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpargP37238 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpargP37238 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpargP37238 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpargP37238 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpargP37238 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 691.3 ms