Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn1P35821 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms