Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RetP35546 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RetP35546 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RetP35546 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RetP35546 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RetP35546 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RetP35546 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RetP35546 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RetP35546 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RetP35546 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RetP35546 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RetP35546 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RetP35546 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RetP35546 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RetP35546 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RetP35546 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RetP35546 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RetP35546 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms