Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin1P35438 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin1P35438 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin1P35438 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin1P35438 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin1P35438 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms