Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpardP35396 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpardP35396 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpardP35396 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpardP35396 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpardP35396 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpardP35396 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpardP35396 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpardP35396 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpardP35396 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PpardP35396 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpardP35396 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpardP35396 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpardP35396 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpardP35396 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpardP35396 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpardP35396 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpardP35396 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpardP35396 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PpardP35396 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpardP35396 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpardP35396 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PpardP35396 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PpardP35396 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PpardP35396 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PpardP35396 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PpardP35396 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PpardP35396 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PpardP35396 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PpardP35396 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PpardP35396 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PpardP35396 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpardP35396 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpardP35396 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpardP35396 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpardP35396 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpardP35396 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpardP35396 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpardP35396 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpardP35396 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpardP35396 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpardP35396 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PpardP35396 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms