Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab20P35295 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms