Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprmP28828 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprmP28828 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprmP28828 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprmP28828 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprmP28828 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprmP28828 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprmP28828 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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