Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BgnP28653 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BgnP28653 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BgnP28653 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BgnP28653 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BgnP28653 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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