Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Myf5P24699 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Myf5P24699 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Myf5P24699 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Myf5P24699 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms