Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PparaP23204 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PparaP23204 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PparaP23204 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PparaP23204 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PparaP23204 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PparaP23204 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PparaP23204 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PparaP23204 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PparaP23204 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PparaP23204 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PparaP23204 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PparaP23204 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PparaP23204 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PparaP23204 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PparaP23204 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PparaP23204 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PparaP23204 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PparaP23204 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PparaP23204 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PparaP23204 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PparaP23204 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PparaP23204 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PparaP23204 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PparaP23204 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PparaP23204 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PparaP23204 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PparaP23204 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PparaP23204 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PparaP23204 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PparaP23204 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PparaP23204 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PparaP23204 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PparaP23204 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PparaP23204 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PparaP23204 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PparaP23204 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PparaP23204 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PparaP23204 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PparaP23204 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PparaP23204 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PparaP23204 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PparaP23204 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms