Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm3P21107 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3P21107 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms