Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb9P20615 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms