Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifrd1P19182 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifrd1P19182 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms