Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtpraP18052 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpraP18052 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpraP18052 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpraP18052 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpraP18052 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpraP18052 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms