Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnc1P15388 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnc1P15388 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms