Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnmt1P13864 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnmt1P13864 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms