Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb2P13373 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms