Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lamp1P11438 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lamp1P11438 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms