Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3cP0DOY1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3cP0DOY1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms